山东省教育科学研究院成立于2015年7月16日，为省教育厅所属处级公益一类事业单位，经费来源为财政拨款。主要职责是：承担教育规划、管理、改革等研究工作，提出教育改革发展建议，为教育决策提供服务；承担教育教学理论与应用研究，开展教育教学实验，推广教育科研成果，提供相关咨询服务。
山东省教育科学研究院是山东省教育厅直属的从事教育科学研究和咨询服务、具备独立法人资格的公益一类事业单位。
山东省教育科学研究院其前身为1956年成立的山东省教学研究室、1979年成立的山东省教育科学研究所和1992年成立的山东职业教育与成人教育研究所。2015年7月上述三个单位合并，成立山东省教育科学研究院。
根据山东省机构编制委员会和山东省教育厅的文件，山东省教育科学研究院的主要职责是：负责教育教学理论与应用研究，承担教育科研课题，促进教育科学的发展；负责教育规划、教育管理、教育政策与人力资源开发研究，为教育发展与改革的重要决策提供咨询服务；组织开展教育教学实验研究，总结科研经验，推广教育科研成果，为各级各类院、校的教育教学改革发展提供理论研究和实践指导；组织开展教育科研的国际国内合作与交流，借鉴和汲取世界各国教育发展的有益经验，为教育改革发展服务;参与全省学校教育课程和教材建设工作；参与全省各类教育教学质量评估、教学评价、监测工作；承担山东省教育厅委托的其他工作。
山东省教科院设有教育发展战略研究所、基础教育研究所、职业教育研究所、高等教育研究所、继续教育研究所、教育评估所、教师发展研究中心、教育媒体发展中心和传统文化教育中心等9个中心、所和院办公室（党委办），并设有《当代教育科学》杂志社、《中国成人教育》杂志社和《现代教育》杂志编辑部。挂靠 机构有山东省教育科学规划领导小组办公室等、社团组织有山东省教育学会、山东成人教育协会等。
2021年9月26日，荣获全国教材建设先进集体称号。