东方医院筹建于1986年，于1999年12月12日正式开业，是北京中医药大学第二临床医学院，国家中医药管理局直管单位，国家中医临床研究基地建设单位，是一所特色明显、功能齐全、设备先进，集医疗、教学、科研、预防和健康咨询为一体的三级甲等中医医院，是直属教育部管理、进入国家“211工程”建设的北京中医药大学所属附属医院，北京市医疗保险定点医院。医院现为一院三区：即东方医院方庄院区、东方医院西院区(二七院区)、东方医院南院区（经开区院区）。总占地面积5.68万平方米，总建筑面积12.43万平方米。东方医院目前编制床位为1377张。医院设有临床、医技科室39个，采取以中医为主、中西医结合的诊疗模式。
北京中医药大学东方医院是北京中医药大学第二临床医学院，是国家中医药管理局直管单位，是全国三级甲等中医医院。